从发生机制来说，分子氢扫除疲劳是通过调整人体内部氧化还原状态；而咖啡因则是通过对大脑皮质选择性兴奋作用，减轻疲劳感。而服用富氢水无成瘾性，在当前的科学研究中也尚未发现富氢水的副作用，这大概也是分子氢与咖啡因相比更具潜力的原因。